Boa tarde, @gabriel.barros! Tudo bem?
Sim, não há limite de integração para uma mesma API com um único par de credenciais. No entanto, se você estiver trabalhando com sistemas diferentes, recomendamos que crie uma nova aplicação na conta.
Cada conta Efí pode ter várias aplicações, o que facilita a organização e a gestão das integrações.
Se precisar de mais alguma coisa, estou à disposição!