Você precisa informar o path do certificado na variável que armazena as informações de integração. Exemplo:
module.exports = {
// PRODUÇÃO = false
// HOMOLOGAÇÃO = true
sandbox: false,
client_id: 'seuClientId',
client_secret: 'seuClientSecret',
pix_cert: 'caminhoAteOCertificadoPix',
};