Entendi. No caso do Link de Pagamento, assim que você gera a cobrança, ela irá manter o status link, pois o cliente ainda não entrou no link e inseriu seus dados e método de pagamento. Assim que o cliente fizer isto, caso o cliente selecione o método de pagamento com cartão de crédito, primeiro passará pelo status waiting, e rapidamente o pagamento será aprovado automaticamente, passando para o status paid.
Caso o cliente selecione pagar com boleto, a cobrança sairá do status link para waiting, até que o boleto seja pago (passando para paid) ou até você passar para settled.