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Você está pensando com uma única empresa. Eu no caso estou fazendo uma poc que meus clientes podem criar a conta na gerencia net e com o mínimo de configuração possa fazer todo o setup necessário. Como disse, para uma empresa com um único sistema não é tão útil. Não tem nada a ver com criar N chaves
Para esse caso de uso existe a API de criação de contas... mas que também não está disponível em ambiente de homologação. Um uso conjunto criação da conta/aplicação+criação da chave faz sentido automatizar, um só da chave, não, IMHO.
De qualquer forma, a criação de chave é uma transação sem custo no ambiente de produção.