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Tenho esse endpoint tambem configurado(webhook/pix). O meu sistema roda em um vps com litespeed, nao encontrei enhum exemplo para litespeed. Outra coisa que nao ta batendo é que consigo acessar o endpoind (tanto o /webhook quando o /webhook/pix) pelo postman, pelo que entendi era pra dar erro 403, porem tb nao deveria poder registrar o webhook neste caso.

Sim, se você não passou o x-skip-mtls-check, deveria falhar na configuração do webhook.
O que você pode consultar que pode trazer uma luz é o log do litespeed...