Ao criar a cobrança, você pode definir uma URL de notificação!
Quando você define uma URL, a Gerencianet envia para essa URL uma notificação sempre que o status de alguma cobrança for alterada!
Dessa forma, você não precisa ficar consultando para saber se determinada cobrança foi paga!
A Gerencianet já te informa através da URL definida.