Se tiver nome fantasia cadastrado (na Receita e na Efí), ele é preferencial em relação à razão social para aparecer em cobranças Pix. Cartão e boleto não sei como a Efí trata.
Mas precisa conferir que esteja na Efí com o nome fantasia, pode ser preciso recriar a chave Pix caso a informação tenha sido adicionada depois.