A nova página de tarifas (https://sejaefi.com.br/tarifas) ficou devendo duas informações:
- Que a tarifa mínima é 1 centavo
- Qual o critério de arredondamento do cálculo de tarifa
Essas informações estavam disponíveis na página antiga, da Gerencianet... acho que isso é bem relevante.
De qualquer forma, uma opção interessante é ligar o envio da tarifa cobrada no webhook. Aí você já tem como conciliar recebimentos, tarifas e saldo.