Um pouquinho de esforço e boa vontade não faz mal a ninguém meu amigo.
Basta vc converter o p12 para pem e ter tudo funcionando corretamente indepdentende da versão do WHMCS neste caso.
Para quem tiver o mesmo problema, use
openssl pkcs12 -in producao-XXXXXX-whmcs.p12 -out producao-XXXXX-whmcs.pem -nodes
No caminho do certificado, dentro do WHMCS, aponte para o arquivo .pem e não .p12
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