Ah sim, entendi. No caso, nosso plug-in oficial possui integração somente junto com o WooCommerce.
Em seu cenário, vejo então que seria necessário você desenvolver a integração com os endpoints de emissão de boletos de acordo com sua necessidade.
Para tornar essa integração mais fácil, você pode utilizar nossa SDK de PHP. Com ela, você só precisaria seguir o exemplo do "createOneStepBillet.php" para emitir um boleto.