Histórico de mensagens em pix

Não é numa página é no app. E sim é com ../diretório/certificado.

Mas então como referenciar esta pasta a partir de uma página que fica dentro do ste? Fazendo ../ não funciona pois dentro do site os links vão no máximo até a raiz do site: /

É possível, mas o certificado precisa ficar num local não publicado via Web. Tipicamente é uma pasta que tem como parent a mesma localização que tem o DOCROOT.