Outro detalhe é a adição do /pix no final da sua URL que deve ser tratada no location das configurações de seu Nginx.
Ou seja, na request PUT https://api-pix.gerencianet.com.br/v2/webhook/:chave você irá passar o body com sua URL, exemplo:
No entanto, a URL será registrada com o /pix no final, assim:
https://seudominio.com.br/webhook/pix.
Então esta adição do
/pix também dever ser tratada nas configurações do Nginx para que na rota
/webhook/pix de seu servidor exija o certificado CA da Gerencianet e recebe o body a partir dela.