@sergiomsa você pode sim utilizar um serviço do painel e outro da API. Porém, deve estar ciente de que o que é gerado no painel não é repassada para a API e vice versa. Ou seja, além de não conseguir consultar a cobrança gerada no painel, por exemplo, também não vai receber as baixas no seu sistema, como acontece no caso da API. Também não é possível migrar a origem de uma emissão (painel - api ou api-painel).
Termos mais procurados: