Espera-se que sim. Ele vai conseguir cadastrar a URL. Quando for notificado, nós enviaremos o certificado. Isso abre caminhos para que o integador decida como validar que a requisição que está chegando é realmente da Gerencianet. Talvez ele não possa alterar uma configuração do nginx por estar sendo compartilhado com outras aplicações, porém talvez ele possa "ensinar" o nginx a repassar essa informação pra dentro da aplicação e validar manualmente via código.
A ideia da validação durante o PUT é pra ajudar a validar o ambiente mTLS, não seria, digamos, mandatória.