As variações são gerenciadas por outro plugin, pois elas entram como campos adicionais e não como variação (padrão do Woocommerce)
o plugin é o Advanced Product Fields Pro for WooCommerce (Versão 2.7.3 | Por StudioWombat).
Esse problema ocorre em todos tipos de pagamento e infelizmente apenas com o plugin de vocês. Já ativei o modo de compatibilidade do WooCommerce, mas mesmo assim o erro persiste.
acabei colocando o nome do plugin errado, corrigi agora.
