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Ate ja dei uma olhada em ambos os logs mas não consegui achar nada relevante. Mas isso foi logo no inicio qdo ainda tava tentando registrar o webhook, vou dar outra olhada.

access-log e error-log do Litespeed vão indicar o que pode ter passado...

Entendi, vou dar mais uma conferia em tudo, posso ter deixado alguma coisa passar, obrigado pela ajuda.

O que você deveria encontrar lá:
Um acesso em meu-dominio/webhook com a CA da Efí, dando 2xx;
Um acesso em meu-dominio/webhook sem a CA da Efí, dando 4xx;
Um acesso em meu-dominio/webhook/pix de quando o pagamento foi confirmado

Sim, se você não passou o x-skip-mtls-check, deveria falhar na configuração do webhook.
O que você pode consultar que pode trazer uma luz é o log do litespeed...

Tenho esse endpoint tambem configurado(webhook/pix). O meu sistema roda em um vps com litespeed, nao encontrei enhum exemplo para litespeed. Outra coisa que nao ta batendo é que consigo acessar o endpoind (tanto o /webhook quando o /webhook/pix) pelo postman, pelo que entendi era pra dar erro 403, porem tb nao deveria poder registrar o webhook neste caso.